中國晶體學(xué)會前身為國際晶體學(xué)聯(lián)合會中國委員會，1978年以該名義加入國際晶體學(xué)聯(lián)合會（International Union of Crystallography，IUCr）。1984年唐有祺院士當選為該會第十三屆執(zhí)行委員，1987年又當選為該會第十四屆副主席。1999～2005年中國科協(xié)書記張澤院士任執(zhí)行委員會委員。1993年在北京成功舉辦了國際晶體學(xué)聯(lián)合會第十六屆學(xué)術(shù)大會與會員代表大會，加強了國際晶體學(xué)界對我國晶體學(xué)領(lǐng)域的了解，擴大了國際影響。1993年3月30日經(jīng)國家科委批準成立中國晶體學(xué)會，4月9日經(jīng)中國科學(xué)技術(shù)協(xié)會致民政部準予登記，8月19日經(jīng)民政部批準登記、注冊，學(xué)會成立。首屆理事長為唐有祺。會址設(shè)在北京大學(xué)。學(xué)會目前為第六屆理事會。歷屆理事長為：唐有祺、閔乃本、饒子和、林建華、高松。

中國晶體學(xué)會現(xiàn)有個人會員1890人、單位會員46個，下設(shè)小分子、生物大分子、粉末衍射、晶體生長與材料表征、電子顯微學(xué)、藥物晶體學(xué)，極端條件晶體材料等7個專業(yè)委員會和晶體學(xué)教育與普及工作委員會。已加入2個國際組織：國際晶體學(xué)聯(lián)合會、亞洲晶體學(xué)協(xié)會。